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紀錄一下 GBIF 上幾個台灣的資料集變遷

GBIF 上從 TaiBIF 發布的資料集經過幾十年的累積,有一些狀態變遷,並非只是單純的筆數增加,同一批資料很可能已經換成另一個 dataset:新的 key、新的 DOI...,這常會讓資料查詢者造成困擾,這邊就我所知道的簡單紀錄一下各資料集的變遷歷程。

資料集變遷的原因

大概是這幾種原因:

  • 當初是為了某個短期計畫而發布:計畫有期程,上架的內容通常侷限在那幾個年度、那幾個類群;但原始資料後端資料庫(非IPT)還是持續累積資料,久了計畫版的資料集就跟現況差很多。
  • 發布單位變動:早期不少資料雖然是由TaiBIF代為上架,發布單位是掛數位典藏計畫(TELDAP)或計畫所屬單位(林務局),不是原始資料的產生者。後來各單位自己註冊成為 GBIF 的發布單位,資料就搬到自己名下重新發布。
  • 處理資料的人員異動:原本資料的匯出流程沒有交接,很難接續,所以乾脆重新整理發布。
  • 處理資料的流程異動:可能因為管理系統更新、對資料填入資料標準有不同的處理方式、或是發布工具的更新,舊資料集難以更新,就會另外發布一個資料集。就資料發布工具來說,早期是用TAPIR(2009以前),而不是現在通用的IPT
  • 資料核心結構 (core) 變化:例如從 occurrence 改成 sampling event,欄位對應整個重做,也就不會沿用原本的資料集。

不管是哪一種,對使用者來說結果都一樣:資料集的 key 跟 DOI 換了

臺灣兩棲類資源調查

以前是因為林務局的計畫而上傳/發布資料集,計畫結束後就停在那裡,但是後續資料庫持續累積資料。另外這次也換了發布單位跟資料集結構,兩份舊的都被新的一份取代:

舊(GBIF) 舊(只在 IPT)
名稱 臺灣兩棲類資源調查與教育宣導推廣計畫 外來種斑腿樹蛙控制與監測計畫 臺灣兩棲類資源調查網 (Taiwan Amphibians Database)
位置 2de58bfe… ipt.taibif.tw a10200616 1d9b55a1…
DOI 10.15468/n3rqfv 無(未註冊到 GBIF) 10.15468/kcja4b
發布單位 林務局/FANCA 林務局/FANCA 台灣兩棲類動物保育協會
型態 Occurrence Occurrence Sampling Event
筆數 91,356(102–105 年) 1,516(2013 斑腿樹蛙) 379,397
最後發布 2017-061 2014-091 2026-03

兩份舊的都是林務局的計畫成果,以計畫為單位上架;新的改由協會自己維護、持續更新,而且從 occurrence 改成 sampling event,有調查事件(時間、樣點、方法)可以接,做族群趨勢分析比較有用。a10200616 那份斑腿樹蛙移除監測資料一直只放在 IPT、沒有註冊到 GBIF,所以用 GBIF 搜是找不到的。

國立臺灣博物館 NTM

名稱 National Taiwan Museum Biological Collection of the National Taiwan Museum, Taipei, Taiwan
dataset ca22abc0… 24f1ac6a…
DOI 10.15468/mpqvtt 10.15468/fxzm63
發布單位 TELDAP National Taiwan Museum
筆數 1,470(只有魚類) 75,432(魚、鳥、貝、甲殼、兩爬…)
最後發布 2014-03 2025-11

舊的那份是數位典藏時期(TELDAP)代發布的魚類標本;新的是臺博館自己以發布單位身分上架的生物學組典藏,範圍大很多。舊 dataset 目前還在線上,但內容停在 2014 年那版,沒有再更新。

特生中心植物標本館 TAIE

這份資料集除了原始資料管理系統更新,機構名字也換了(特有生物研究保育中心於 2023 年改制為農業部生物多樣性研究所):

名稱 Endemic Species Research Institute–Herbarium Herbarium of Taiwan Biodiversity Research Institute, TAIWAN (TAIE)
dataset bc76c690… 19c3400b…
DOI 10.15468/zbmpzt 10.15468/4uvvfx
發布單位 TELDAP Taiwan Biodiversity Research Institute
型態/筆數 Metadata-only,0 筆 Occurrence,54,508 筆
最後發布 2023-03 2026-07

跟 NTM 一樣是 TELDAP → 機構自己發布,不過舊的沒有被刪除,而是降成 metadata-only,並且在描述最上面直接寫了一句「The dataset has been updated to …」附新網址,交代的很清楚。

中研院生物多樣性研究博物館植物標本館 HAST

名稱 Database of Native Plants in Taiwan Herbarium, Biodiversity Research Museum, Academia Sinica (HAST)
dataset 96c33790… 10cfe1fe…
DOI 10.15468/h1txwb 10.15468/c664ha
發布單位 TELDAP Biodiversity Research Museum, Academia Sinica, Taiwan
筆數 84,866 -> 0(已降為 metadata-only) 126,706
狀態 2014-03,2026-05-18 已被 GBIF 刪除,標記為新資料集的 duplicate 2025-10 上架

舊的已經被 GBIF 標為 deleted,並且填了 duplicateOfDatasetKey 指向新的那份,所以舊頁面只剩存查用。授權也從 CC BY 4.0 變成 CC BY-NC 4.0,要注意。

要注意的地方

  • DOI 換了,引用不連續。舊 DOI 在 GBIF literature 累積的引用(HAST 1,282 篇、TAIE 551 篇、NTM 167 篇、兩棲類 110 篇)不會自動轉到新 dataset 名下(新的分別是 19、597、210、65 篇)。做引用統計或成效報告時要記得兩份都算。

(資料狀態查詢時間:2026-08-10,來自 GBIF Registry API)


  1. 排除掉因為IPT管理員更新造成的"新發布版本"。