紀錄一下 GBIF 上幾個台灣的資料集變遷
GBIF 上從 TaiBIF 發布的資料集經過幾十年的累積,有一些狀態變遷,並非只是單純的筆數增加,同一批資料很可能已經換成另一個 dataset:新的 key、新的 DOI...,這常會讓資料查詢者造成困擾,這邊就我所知道的簡單紀錄一下各資料集的變遷歷程。
資料集變遷的原因
大概是這幾種原因:
- 當初是為了某個短期計畫而發布:計畫有期程,上架的內容通常侷限在那幾個年度、那幾個類群;但原始資料後端資料庫(非IPT)還是持續累積資料,久了計畫版的資料集就跟現況差很多。
- 發布單位變動:早期不少資料雖然是由TaiBIF代為上架,發布單位是掛數位典藏計畫(TELDAP)或計畫所屬單位(林務局),不是原始資料的產生者。後來各單位自己註冊成為 GBIF 的發布單位,資料就搬到自己名下重新發布。
- 處理資料的人員異動:原本資料的匯出流程沒有交接,很難接續,所以乾脆重新整理發布。
- 處理資料的流程異動:可能因為管理系統更新、對資料填入資料標準有不同的處理方式、或是發布工具的更新,舊資料集難以更新,就會另外發布一個資料集。就資料發布工具來說,早期是用TAPIR(2009以前),而不是現在通用的IPT。
- 資料核心結構 (core) 變化:例如從 occurrence 改成 sampling event,欄位對應整個重做,也就不會沿用原本的資料集。
不管是哪一種,對使用者來說結果都一樣:資料集的 key 跟 DOI 換了。
臺灣兩棲類資源調查
以前是因為林務局的計畫而上傳/發布資料集,計畫結束後就停在那裡,但是後續資料庫持續累積資料。另外這次也換了發布單位跟資料集結構,兩份舊的都被新的一份取代:
| 舊(GBIF) | 舊(只在 IPT) | 新 | |
|---|---|---|---|
| 名稱 | 臺灣兩棲類資源調查與教育宣導推廣計畫 | 外來種斑腿樹蛙控制與監測計畫 | 臺灣兩棲類資源調查網 (Taiwan Amphibians Database) |
| 位置 | 2de58bfe… | ipt.taibif.tw a10200616 |
1d9b55a1… |
| DOI | 10.15468/n3rqfv | 無(未註冊到 GBIF) | 10.15468/kcja4b |
| 發布單位 | 林務局/FANCA | 林務局/FANCA | 台灣兩棲類動物保育協會 |
| 型態 | Occurrence | Occurrence | Sampling Event |
| 筆數 | 91,356(102–105 年) | 1,516(2013 斑腿樹蛙) | 379,397 |
| 最後發布 | 2017-061 | 2014-091 | 2026-03 |
兩份舊的都是林務局的計畫成果,以計畫為單位上架;新的改由協會自己維護、持續更新,而且從 occurrence 改成 sampling event,有調查事件(時間、樣點、方法)可以接,做族群趨勢分析比較有用。a10200616 那份斑腿樹蛙移除監測資料一直只放在 IPT、沒有註冊到 GBIF,所以用 GBIF 搜是找不到的。
國立臺灣博物館 NTM
| 舊 | 新 | |
|---|---|---|
| 名稱 | National Taiwan Museum | Biological Collection of the National Taiwan Museum, Taipei, Taiwan |
| dataset | ca22abc0… | 24f1ac6a… |
| DOI | 10.15468/mpqvtt | 10.15468/fxzm63 |
| 發布單位 | TELDAP | National Taiwan Museum |
| 筆數 | 1,470(只有魚類) | 75,432(魚、鳥、貝、甲殼、兩爬…) |
| 最後發布 | 2014-03 | 2025-11 |
舊的那份是數位典藏時期(TELDAP)代發布的魚類標本;新的是臺博館自己以發布單位身分上架的生物學組典藏,範圍大很多。舊 dataset 目前還在線上,但內容停在 2014 年那版,沒有再更新。
特生中心植物標本館 TAIE
這份資料集除了原始資料管理系統更新,機構名字也換了(特有生物研究保育中心於 2023 年改制為農業部生物多樣性研究所):
| 舊 | 新 | |
|---|---|---|
| 名稱 | Endemic Species Research Institute–Herbarium | Herbarium of Taiwan Biodiversity Research Institute, TAIWAN (TAIE) |
| dataset | bc76c690… | 19c3400b… |
| DOI | 10.15468/zbmpzt | 10.15468/4uvvfx |
| 發布單位 | TELDAP | Taiwan Biodiversity Research Institute |
| 型態/筆數 | Metadata-only,0 筆 | Occurrence,54,508 筆 |
| 最後發布 | 2023-03 | 2026-07 |
跟 NTM 一樣是 TELDAP → 機構自己發布,不過舊的沒有被刪除,而是降成 metadata-only,並且在描述最上面直接寫了一句「The dataset has been updated to …」附新網址,交代的很清楚。
中研院生物多樣性研究博物館植物標本館 HAST
| 舊 | 新 | |
|---|---|---|
| 名稱 | Database of Native Plants in Taiwan | Herbarium, Biodiversity Research Museum, Academia Sinica (HAST) |
| dataset | 96c33790… | 10cfe1fe… |
| DOI | 10.15468/h1txwb | 10.15468/c664ha |
| 發布單位 | TELDAP | Biodiversity Research Museum, Academia Sinica, Taiwan |
| 筆數 | 84,866 -> 0(已降為 metadata-only) | 126,706 |
| 狀態 | 2014-03,2026-05-18 已被 GBIF 刪除,標記為新資料集的 duplicate | 2025-10 上架 |
舊的已經被 GBIF 標為 deleted,並且填了 duplicateOfDatasetKey 指向新的那份,所以舊頁面只剩存查用。授權也從 CC BY 4.0 變成 CC BY-NC 4.0,要注意。
要注意的地方
- DOI 換了,引用不連續。舊 DOI 在 GBIF literature 累積的引用(HAST 1,282 篇、TAIE 551 篇、NTM 167 篇、兩棲類 110 篇)不會自動轉到新 dataset 名下(新的分別是 19、597、210、65 篇)。做引用統計或成效報告時要記得兩份都算。
(資料狀態查詢時間:2026-08-10,來自 GBIF Registry API)