筆記一點關於古生物的Darwin Core詞彙
目前Darwin Core已儼然成為生物多樣性開放資料共同標準，針對古生物標本也有一些相關詞彙可用，跟現生生物標本資料最大不同的是必填欄位basisOfRecord要用FossilSpecimen。(非PreservedSpecimen或LivingSpecimen)。
Geological Context
Geological Context這個Class應該就定義了大多數地層資訊用到的詞彙，列舉常用的如下：
地層學 (Stratigraphy)可以細分成可以細分岩石地層學 (Lithostratigraphy)、生物地層學 (Biostratigraphy)、年代地層學 (Chronostratigraphy)...
年代地層學（Chronostratigraphy）
| 層級 | Earliest 詞彙 | Latest 詞彙 | 範例 |
|---|---|---|---|
| Eon / Eonothem | earliestEonOrLowestEonothem |
latestEonOrHighestEonothem |
Phanerozoic |
| Era / Erathem | earliestEraOrLowestErathem |
latestEraOrHighestErathem |
Cenozoic |
| Period / System | earliestPeriodOrLowestSystem |
latestPeriodOrHighestSystem |
Neogene |
| Epoch / Series | earliestEpochOrLowestSeries |
latestEpochOrHighestSeries |
Holocene |
| Age / Stage | earliestAgeOrLowestStage |
latestAgeOrHighestStage |
Atlantic, Boreal |
岩石地層學（Lithostratigraphy）
| 層級 | 詞彙 |
|---|---|
| 群 | group |
| 層（組） | formation |
| 段 | member |
| 小層 | Bed |
生物地層學 (Biostratigraphy)
| Earliest 詞彙 | Latest 詞彙 | 範例 |
|---|---|---|
lowestBiostratigraphicZone |
highestBiostratigraphicZone |
Maastrichtian |
但原始資料遇到"晚中新世" (Late Miocene) 這種資料要如何處理？
問了一輪Digital TaiBIFer (TaiBIF開發，架構在ChatGPT上專注於生物多樣性開放資料的AI問答小幫手)，得到的答案整理如下：
Late/Early/Middle加上地層單元名稱很常使用，但不是正式單元名稱，原始資料的"晚中新世"可以用以下表示：
| terms | value |
|---|---|
| earliestAgeOrLowestStage | Tortonian |
| latestAgeOrHighestStage | Messinian |
我的理解：晚中新世下有6個Age/Stage，剛好3等分(Early/Late/Middle)後，最"Late"的2個是Tortonian跟Messinian => 但身為一個中間處理資料的角色，我認為不應該任意解讀原始資料的轉換，所以決定保留"Miocene"，再想辦法處理"Late"這個字。因為早/中/晚一個想要表達精準一點但又沒那麼精準的定義，而且也不是每個單元名稱都可以3等分，有些除了早/中/晚也會用地層的上/下表示，這些用詞雖然模糊，但也保留了彈性，應該要被留下來，所以控制詞彙用以下處理：
| terms | value |
|---|---|
| earliestEpochOrLowestSeries | Miocene |
| latestEpochOrHighestSeries | Miocene |
ChatGPT叫我把"Late"放到geologicalContextRemarks或verbatimGeologicalContext紀錄裡，聽起來很合理，但目前(2026-03-06)標準並沒有這個詞彙（ChatGPT腦補?）
我目前也還沒想到放那邊比較適合，另外可以放的地方是occurrenceRemarks跟dynamicProperties (萬用自訂欄位)，但也怕會埋藏在雜亂的訊息中不容易被連結到，我先放個 TODO 在這邊，等那天智慧比較開了再來補充。
另外有一個看起來有關聯的 Chronometric Age Extension
Chronometric Age Extension，如果資料有特別做"年代測定"的方法、可以用精準一點的數值表示的話，就適合加上這個Extension。這邊我就懶的整理直接照抄AI給的答案跟TDWG網頁的內容。
The Chronometric Age (Chrono) terms are specifically for numerical ages (e.g., 10,000 years BP) or the specific process of dating a material. A "Formation" is a spatial/geological unit, which Darwin Core handles in its GeologicalContext class.
| terms | value |
|---|---|
| chrono:verbatimChronometricAge | 76.6 to 74.5 Ma |
| chrono:chronometricAgeProtocol | Ar-Ar dating of volcanic ash |
比較跟DarwinCore的Geological Context不同
| Feature | Geological Context (DwC) | Chronometric Age (Chrono) |
|---|---|---|
| Data Type | Descriptive names (Strings) | Numbers & Units (Floats/Integers) |
| Primary Goal | Classification | Measurement |
| Example Value | "Late Miocene" | "11.6 to 5.33 Ma" |
| Method Info | Usually implied or omitted | Explicit (e.g., "AMS Radiocarbon") |
| Uncertainty | Hard to quantify (Vague) | Precise (e.g., "± 50 years") |
| Best For | General collection management | Research-grade geochronology |
Use Chrono only if you start adding columns like "Date Method," "Lab Number," or "Error Margin."
另外還有一個頭更大的學名處理
除了舊學名這個老問題，古生物還會遇到：已滅絕物種、分類不確定等、這個我暫時也是先放個 TODO 在這邊，有空再回來。
參考資料
- Darwin Core List of Terms - Darwin Core
- Chronometric Age Vocabulary List of Terms - Chronometric Age Extension
- International Commission on Stratigraphy
- 年代地層學 - 維基百科，自由的百科全書
- 地層學-古生物學入門（三）
地層名稱相關
- 台灣的化石地層簡介
- 地質雲加值應用平臺 - 首頁 有提供API，swagger文件
- 二十五萬分之一臺灣區域地質圖數值檔-臺灣 ｜ 政府資料開放平臺 提供csv，但裡面是WMS的URL清單
- 地質資料整合查詢 線上圖台做的不錯，但可能沒有下載資料的地方 (也許是我不會用)
